ExomeXtra®

Die umfassendste Diagnostik zur Ermittlung seltener Erkrankungen

(Einzel/Duo/Trio)-Exom-Diagnostik mit ExomeXtra®

Die Summe aller kodierenden Bereiche des Genoms wird als Exom bezeichnet. Obwohl das Exom nur 1 % bis 2 % des Genoms ausmacht, befinden sich circa 89 % aller bekannten krankheitsverursachenden Varianten darin. Allerdings können krankheitsverursachende Varianten auch in nicht-kodierenden Regionen vorkommen. Diese Varianten werden bei der klassischen Exom-Diagnostik nicht ermittelt.

Unser Ziel ist es, alle genetisch bedingten Krankheitsfälle zu lösen. Dafür verwenden wir ExomeXtra® – eine diagnostische Lösung, die die Vorteile von Genom-, Exom- und Array-CGH-Analysen in einem einzigen Test kombiniert. Durch die gezielte Erweiterung um medizinisch relevante Regionen außerhalb des Exoms löst ExomeXtra® deutlich mehr Patientenfälle als klassische Exom-Diagnostik. ExomeXtra® ermöglicht eine maximale diagnostische Ausbeute und ist besonders wertvoll für Patientinnen und Patienten mit komplexen oder unklaren Symptomen.

Unsere ExomeXtra®-Diagnostik umfasst die Sequenzierung, bioinformatische Analyse und die Erstellung eines medizinischen Befunds – alles aus einer Hand.

Für weiterführende Informationen oder Beratung kontaktieren Sie unser Diagnostic-Support Team.

Liste der akkreditierten Verfahren

Einsendeformular ExomeXtra®

Einsendeformular pränatales ExomeXtra®

Prozessablauf

Blaues Icon mit Arzt, der eine genetische Beratung durchführt

Ärztliche
genetische Beratung

Blaues Icon mit einer Probenversandbox und einer Blutprobe für die genetische Analyse

Beauftragung und
Probenversand

Blaues Icon mit einer Lupe, die eine DNA untersucht

Probenbearbeitung und
bioinformatische Analyse

Blaues Icon mit einem Befund, der die Ergebnisse der humangenetischen Diagnostik darstellt

Befundübermittlung
und Beratung

INFORMATION

Unsere Exom-Diagnostik mit ExomeXtra® identifiziert ca. 60.000 genetische Varianten pro Individuum. Da nicht jede dieser Veränderungen klinisch relevant ist, erfordert die Analyse eine präzise bioinformatische Filterung und medizinische Interpretation. Unser interdisziplinäres Team aus Wissenschaftlerinnen, Wissenschaftlern und Fachärztinnen und Fachärzten für Humangenetik evaluiert die detektierten Varianten, um krankheitsrelevante Veränderungen zu identifizieren.

Für eine schnelle und fokussierte Interpretation berücksichtigen wir das Krankheitsbild und die Symptome. Hierzu erstellen wir eine spezifische Kandidatengen-Liste, die alle mit dem Krankheitsbild assoziierten Gene umfasst. Varianten in diesen Genen werden medizinisch bewertet und in einem leicht verständlichen Befund zusammengefasst.

Warum ExomeXtra® mehr bietet als klassische Exom-Diagnostik

Die Sequenzierung des Exoms ist insbesondere dann von Bedeutung, wenn kein spezifisches Gen-Panel zur Verfügung steht, das die Symptomatik der Patientin oder des Patienten umfassend abdeckt. Das von uns verwendete ExomeXtra® übertrifft die klassische Exom-Diagnostik, indem zusätzlich krankheitsrelevante genetische Regionen außerhalb der proteinkodierenden Sequenzen erfasst werden. Dazu gehören unter anderem intronische und intergenische Varianten sowie mitochondriale DNA.

Darüber hinaus ermöglicht ExomeXtra® die array-ähnliche Detektion von Kopienzahlveränderungen (CNVs) sowie die Analyse von Repeat-Expansionen, die mit verschiedenen genetischen Erkrankungen in Verbindung stehen.

Damit identifiziert die Exom-Diagnostik mit ExomeXtra® mehr krankheitsverursachende genetische Veränderungen und steigert die Lösungsrate.

Höhere Aufklärungsrate dank genetischem Abgleich innerhalb der Familie

Im Rahmen unserer Diagnostik können die Sequenzierdaten der Patientin oder des Patienten mit denen anderer Familienmitglieder abgeglichen werden. Durch dieses Verfahren können wir die Anzahl der möglicherweise ursächlichen genetischen Veränderungen stark einschränken und die Lösungsquote drastisch erhöhen. Im Zentrum für Humangenetik Tübingen sind daher mehrere Beauftragungsoptionen möglich:

Einzel-ExomeXtra®
Duo-ExomeXtra®
Elter-Kind-Duo-ExomeXtra®
Trio- oder Quattro-ExomeXtra®

LEISTUNGSUMFANG EXOM-DIAGNOSTIK

Relevante Untersuchungsergebnisse beschreiben wir in einem medizinischen Befund ausführlich und senden ihn den verantwortlichen ärztlichen Kolleginnen und Kollegen zu. Im Rahmen eines erneuten humangenetischen Beratungsgesprächs werden das Ergebnis sowie die daraus resultierenden Konsequenzen an die Ratsuchenden übermittelt. Je nach Fragestellung und Analysetyp (Trio-, Duo- oder Einzel-Exom) berücksichtigen und befunden wir folgende Parameter bei der Datenauswertung:

alle proteinkodierenden Regionen des Genoms
klinisch relevante RNA-Gene
mehr als 46.000 intergenische und intronische Positionen, die laut ClinVar, HGMD und internen Datenbanken mit genetischen Krankheiten in Verbindung stehen
hohe und einheitliche Abdeckung des gesamten mitochondrialen Genoms zur zuverlässigen Erkennung verschiedener Heteroplasmie-Grade
pharmakogenetisch relevante Varianten in ausgewählten Genen
Einzelnukleotid-Varianten (SNV) und kleine Insertionen/Deletionen (InDels)
genomweite Kopienzahlveränderungen (Deletionen/Duplikationen) von einzelnen Exons bis hin zu ganzen Chromosomen
Bereiche mit Verlust der Heterozygotie (ROH)
Detektion von pränatal- und postnatal relevanten Infektionen: Parvovirus B19, Herpes simplex 1 & 2, Varizella zoster, Cytomegalovirus, Treponema pallidum, Toxoplasma gondii
bei Trio (teilw. auch Duo)-Befunden kann noch gezielter analysiert werden:
DeNovo-Varianten, compound Heterozygotien (SNV/SNV | SNV/CNV), Homozygotien, X-gekoppelte Vererbung (Hemizygotie) bei männlichen Patienten, elterlicher Mosaizismus

In unseren Trio-Analysen können wir zudem folgende, oft übersehene Sachverhaltende durch unsere Auswertungsstrategie gezielt berücksichtigen:

reduzierte Penetranz
variable Expressivität
Imprinting-Effekte

Wir erkennen und berichten auch uniparentale Disomien (UPD). UPDs können Krankheiten aufgrund von Imprinting-Effekten, zugrundeliegenden homozygoten pathogenen Varianten oder geringfügigen Mosaikanomalien hervorrufen. Wir sind in der Lage alle vier möglichen UPD-Konstellationen zu ermitteln: maternale Heterodisomien, maternale Isodisomien, paternale Isodisomien und paternale Heterodisomien.

Das macht uns besonders

Blaues Icon mit einem DNA-Strang, der die Basenpaare und Wasserstoffbrückenbindungen enthält

Hauseigenes Exom-Design

Blaues Icon mit einem Bildschirm, der die bioinformatische Auswertung der Gendiagnostik zeigt

Leistungsstarke Bioinformatik

Blaues Icon mit einer Glühbirne, in der sich ein Gehirn befindet

Langjährige Erfahrung

Umfassende Beratung

Beauftragungsoptionen

Einzel-Exom-Diagnostik

Wir sequenzieren das gesamte Exom der Patientin oder des Patienten mittels ExomeXtra®. Basierend auf einer genauen Beschreibung des Phänotyps prüfen wir eine individuelle Liste von Kandidatengenen, die ursächlich für die Symptomatik der Patientin oder des Patienten sein können.

Duo-Exom-Diagnostik

Wir vergleichen die Datensätze zweier Familienmitglieder zur Beurteilung genetischer Veränderungen. Auch der Abgleich der Datensätze einer Patientin oder eines Patienten mit einem nicht betroffenen Familienmitglied ist möglich.

Trio-Exom-Diagnostik

Wir analysieren und gleichen die Datensätze beider gesunder Eltern und des betroffenen Kindes ab. Dies erhöht die Lösungsquote signifikant und ist die Diagnostik der Wahl im pränatalen Bereich und bei schwer betroffenen Kleinkindern.

Beispielbefund

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